Pada tahun 298 era para dewa, gadis SD Washio Sumi, Nogi Sonoko, dan Minowa Gin mengemban misi penting. Mereka menjadi pahlawan dengan melawan Vertex, musuh misterius yang menyerang Shinju-sama, pohon dewa yang melindungi satu-satunya daerah di dunia yang masih layak huni, Shikoku. Namun, mereka tidak menyadari berapa banyak pengorbanan yang harus dibayar untuk pertarungan tersebut.