Yuuki Yuuna wa Yuusha de Aru bercerita dalam kehidupan sehari-harinya , Yuuna Yuuki adalah seorang pahlawan . Sebagai bukti nya dia ada di dalam klub Hero di sekolah nya , di mana dia melakukan yang terbaik untuk membantu orang lain dan membawa senyum ke wajah semua orang .

Tapi Yuuna , yang selalu mengerjakan tugas apa pun , akan menjadi pahlawan yang lebih besar lagi . Kekuatan destruktif misterius yang disebut “Vertex” mulai mengancam dunia yang dicintainya dan Hero Club dipanggil oleh aplikasi telepon aneh untuk menyimpannya . Seiring dengan sahabatnya Mimori Tougou , serta saudara perempuan Fuu dan Itsuki Inubouzaki , mereka harus berubah menjadi Mahou Shoujo melawan Vertex.